Helena Hufnagel, geboren am 1. August 1985 in Gießen, absolvierte zunächst ein Studium der Kommunikationswissenschaft in München. 2009 begann sie ein Studium in den Fächern Medienwirtschaft und Produktion an der Münchner Hochschule für Fernsehen und Film; ebenfalls an der HFF studierte sie Creative Writing bei Doris Dörrie und Fernsehjournalismus bei Dieter Kronzucker.

Ihr studentischer Kurz-Dokumentarfilm "Erntefaktor Null" (2012), über das Kernkraftwerk im österreichischen Zwentendorf, lief unter anderem als Eröffnungsfilm der Sektion DOK.forum beim DOK.fest München 2012 und war für den Deutschen Kurzfilmpreis nominiert. Auch Hufnagels HFF-Abschlussfilm, der 14-minütige "Willa" (2015) nach einer Kurzgeschichte von Stephen King, wurde auf zahlreichen Festivals in aller Welt gezeigt und erhielt mehrere Auszeichnungen.

Mit ihrer Produktionsfirma Cocofilms begann sie 2015 mit den Dreharbeiten zu ihrem Langfilmdebüt "Einmal bitte alles". Die Coming-of-Age-Geschichte über eine frisch gebackene Diplom-Grafikerin zwischen Praktikum, privaten Sorgen und Karriereträumen, wurde im Januar 2017 im Wettbewerb des Filmfestivals Max Ophüls Preis uraufgeführt. Im Juli 2017 startete der Film in den deutschen Kinos. Beim Bayerischen Filmpreis 2018 gewann "Einmal bitte alles" den VGF Preis.

Als Produzentin war Helena Hufnagel an der Comedyserie "Technically Single" (2018) beteiligt. Viel Kritikerlob erhielt ihre "Tatort"-Folge "Die harte Kern" (2019), in der das Weimarer Ermittlerduo Lessing und Dorn einen skurrilen Fall im Umfeld eines Schrottplatzes lösen muss. 

Im Jahr 2020 drehte Hufnagel unter erschwerten Corona-Bedingungen ihren nächsten Kinofilm, die Liebeskomödie "Generation Beziehungsunfähig" mit Frederick Lau und Luise Heyer in den Hauptrollen. Der Start folgte im Sommer 2021.